Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BECN1Q14457 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BECN1Q14457 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BECN1Q14457 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BECN1Q14457 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BECN1Q14457 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BECN1Q14457 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BECN1Q14457 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BECN1Q14457 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BECN1Q14457 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BECN1Q14457 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BECN1Q14457 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BECN1Q14457 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BECN1Q14457 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BECN1Q14457 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BECN1Q14457 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BECN1Q14457 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BECN1Q14457 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BECN1Q14457 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BECN1Q14457 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BECN1Q14457 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
BECN1Q14457 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BECN1Q14457 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BECN1Q14457 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BECN1Q14457 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BECN1Q14457 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BECN1Q14457 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BECN1Q14457 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BECN1Q14457 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BECN1Q14457 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BECN1Q14457 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BECN1Q14457 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BECN1Q14457 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
BECN1Q14457 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BECN1Q14457 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BECN1Q14457 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BECN1Q14457 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BECN1Q14457 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BECN1Q14457 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BECN1Q14457 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BECN1Q14457 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BECN1Q14457 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BECN1Q14457 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BECN1Q14457 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BECN1Q14457 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BECN1Q14457 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BECN1Q14457 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BECN1Q14457 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BECN1Q14457 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BECN1Q14457 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BECN1Q14457 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BECN1Q14457 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BECN1Q14457 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BECN1Q14457 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BECN1Q14457 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BECN1Q14457 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BECN1Q14457 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BECN1Q14457 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BECN1Q14457 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
BECN1Q14457 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
BECN1Q14457 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
BECN1Q14457 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BECN1Q14457 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BECN1Q14457 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BECN1Q14457 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BECN1Q14457 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BECN1Q14457 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BECN1Q14457 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BECN1Q14457 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BECN1Q14457 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BECN1Q14457 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BECN1Q14457 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BECN1Q14457 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
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