Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
UBE4AQ14139 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
UBE4AQ14139 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
UBE4AQ14139 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
UBE4AQ14139 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
UBE4AQ14139 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
UBE4AQ14139 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
UBE4AQ14139 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
UBE4AQ14139 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
UBE4AQ14139 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
UBE4AQ14139 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
UBE4AQ14139 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
UBE4AQ14139 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
UBE4AQ14139 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
UBE4AQ14139 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
UBE4AQ14139 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
UBE4AQ14139 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
UBE4AQ14139 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
UBE4AQ14139 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
UBE4AQ14139 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBE4AQ14139 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBE4AQ14139 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBE4AQ14139 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBE4AQ14139 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBE4AQ14139 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
UBE4AQ14139 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
UBE4AQ14139 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
UBE4AQ14139 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
UBE4AQ14139 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
UBE4AQ14139 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
UBE4AQ14139 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
UBE4AQ14139 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
UBE4AQ14139 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
UBE4AQ14139 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
UBE4AQ14139 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
UBE4AQ14139 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
UBE4AQ14139 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
UBE4AQ14139 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
UBE4AQ14139 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
UBE4AQ14139 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UBE4AQ14139 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBE4AQ14139 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
UBE4AQ14139 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBE4AQ14139 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBE4AQ14139 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBE4AQ14139 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBE4AQ14139 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBE4AQ14139 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBE4AQ14139 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
UBE4AQ14139 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
UBE4AQ14139 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
UBE4AQ14139 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
UBE4AQ14139 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
UBE4AQ14139 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
UBE4AQ14139 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
UBE4AQ14139 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
UBE4AQ14139 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
UBE4AQ14139 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
UBE4AQ14139 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
UBE4AQ14139 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
UBE4AQ14139 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
UBE4AQ14139 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
UBE4AQ14139 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
UBE4AQ14139 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
UBE4AQ14139 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
UBE4AQ14139 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
UBE4AQ14139 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
UBE4AQ14139 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
UBE4AQ14139 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
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