Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VGLL4Q14135 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VGLL4Q14135 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VGLL4Q14135 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VGLL4Q14135 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGLL4Q14135 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VGLL4Q14135 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGLL4Q14135 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VGLL4Q14135 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VGLL4Q14135 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VGLL4Q14135 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
VGLL4Q14135 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VGLL4Q14135 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VGLL4Q14135 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
VGLL4Q14135 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
VGLL4Q14135 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGLL4Q14135 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VGLL4Q14135 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
VGLL4Q14135 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VGLL4Q14135 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VGLL4Q14135 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VGLL4Q14135 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VGLL4Q14135 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VGLL4Q14135 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VGLL4Q14135 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
VGLL4Q14135 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VGLL4Q14135 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
VGLL4Q14135 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
VGLL4Q14135 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VGLL4Q14135 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VGLL4Q14135 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VGLL4Q14135 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VGLL4Q14135 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VGLL4Q14135 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VGLL4Q14135 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VGLL4Q14135 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VGLL4Q14135 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGLL4Q14135 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGLL4Q14135 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGLL4Q14135 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
VGLL4Q14135 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
VGLL4Q14135 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VGLL4Q14135 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
VGLL4Q14135 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VGLL4Q14135 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VGLL4Q14135 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VGLL4Q14135 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VGLL4Q14135 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VGLL4Q14135 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
VGLL4Q14135 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VGLL4Q14135 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VGLL4Q14135 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
VGLL4Q14135 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGLL4Q14135 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGLL4Q14135 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VGLL4Q14135 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
VGLL4Q14135 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VGLL4Q14135 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VGLL4Q14135 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
VGLL4Q14135 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VGLL4Q14135 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
VGLL4Q14135 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VGLL4Q14135 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VGLL4Q14135 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VGLL4Q14135 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VGLL4Q14135 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VGLL4Q14135 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VGLL4Q14135 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
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