Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE1CQ14123 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDE1CQ14123 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE1CQ14123 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE1CQ14123 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE1CQ14123 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE1CQ14123 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE1CQ14123 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE1CQ14123 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE1CQ14123 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE1CQ14123 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE1CQ14123 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE1CQ14123 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE1CQ14123 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE1CQ14123 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE1CQ14123 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE1CQ14123 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE1CQ14123 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE1CQ14123 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE1CQ14123 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE1CQ14123 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE1CQ14123 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE1CQ14123 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE1CQ14123 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE1CQ14123 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE1CQ14123 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE1CQ14123 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE1CQ14123 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE1CQ14123 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE1CQ14123 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE1CQ14123 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE1CQ14123 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE1CQ14123 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE1CQ14123 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE1CQ14123 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE1CQ14123 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE1CQ14123 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE1CQ14123 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE1CQ14123 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE1CQ14123 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
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