Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COTL1Q14019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COTL1Q14019 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms