Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRQ13535 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRQ13535 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRQ13535 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRQ13535 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRQ13535 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRQ13535 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRQ13535 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRQ13535 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRQ13535 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRQ13535 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRQ13535 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRQ13535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRQ13535 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRQ13535 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRQ13535 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRQ13535 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRQ13535 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRQ13535 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRQ13535 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRQ13535 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRQ13535 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRQ13535 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRQ13535 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRQ13535 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRQ13535 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRQ13535 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRQ13535 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRQ13535 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRQ13535 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRQ13535 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRQ13535 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRQ13535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRQ13535 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRQ13535 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRQ13535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRQ13535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRQ13535 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRQ13535 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRQ13535 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRQ13535 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRQ13535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRQ13535 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRQ13535 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRQ13535 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRQ13535 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRQ13535 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRQ13535 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRQ13535 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRQ13535 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRQ13535 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRQ13535 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRQ13535 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRQ13535 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRQ13535 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRQ13535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRQ13535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRQ13535 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRQ13535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRQ13535 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRQ13535 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRQ13535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRQ13535 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms