Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSAMPQ13449 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSAMPQ13449 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSAMPQ13449 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSAMPQ13449 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LSAMPQ13449 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSAMPQ13449 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LSAMPQ13449 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSAMPQ13449 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSAMPQ13449 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSAMPQ13449 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSAMPQ13449 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSAMPQ13449 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSAMPQ13449 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSAMPQ13449 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSAMPQ13449 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSAMPQ13449 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSAMPQ13449 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSAMPQ13449 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
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