Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SF3B2Q13435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SF3B2Q13435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SF3B2Q13435 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SF3B2Q13435 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SF3B2Q13435 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SF3B2Q13435 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SF3B2Q13435 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SF3B2Q13435 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SF3B2Q13435 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
SF3B2Q13435 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SF3B2Q13435 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SF3B2Q13435 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
SF3B2Q13435 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SF3B2Q13435 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SF3B2Q13435 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SF3B2Q13435 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SF3B2Q13435 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SF3B2Q13435 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SF3B2Q13435 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SF3B2Q13435 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SF3B2Q13435 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SF3B2Q13435 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SF3B2Q13435 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SF3B2Q13435 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SF3B2Q13435 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SF3B2Q13435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SF3B2Q13435 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SF3B2Q13435 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SF3B2Q13435 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SF3B2Q13435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SF3B2Q13435 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SF3B2Q13435 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SF3B2Q13435 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
SF3B2Q13435 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
SF3B2Q13435 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SF3B2Q13435 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SF3B2Q13435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SF3B2Q13435 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SF3B2Q13435 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SF3B2Q13435 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SF3B2Q13435 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SF3B2Q13435 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SF3B2Q13435 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SF3B2Q13435 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SF3B2Q13435 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SF3B2Q13435 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SF3B2Q13435 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SF3B2Q13435 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SF3B2Q13435 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SF3B2Q13435 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SF3B2Q13435 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SF3B2Q13435 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SF3B2Q13435 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SF3B2Q13435 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SF3B2Q13435 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SF3B2Q13435 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SF3B2Q13435 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SF3B2Q13435 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SF3B2Q13435 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SF3B2Q13435 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
SF3B2Q13435 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SF3B2Q13435 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
SF3B2Q13435 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SF3B2Q13435 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SF3B2Q13435 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SF3B2Q13435 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SF3B2Q13435 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SF3B2Q13435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SF3B2Q13435 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SF3B2Q13435 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
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