Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRDNQ13061 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRDNQ13061 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRDNQ13061 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRDNQ13061 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRDNQ13061 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRDNQ13061 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRDNQ13061 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRDNQ13061 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRDNQ13061 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRDNQ13061 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRDNQ13061 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRDNQ13061 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRDNQ13061 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRDNQ13061 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRDNQ13061 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRDNQ13061 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRDNQ13061 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRDNQ13061 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRDNQ13061 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRDNQ13061 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRDNQ13061 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRDNQ13061 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRDNQ13061 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRDNQ13061 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRDNQ13061 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TRDNQ13061 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRDNQ13061 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRDNQ13061 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRDNQ13061 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRDNQ13061 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRDNQ13061 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRDNQ13061 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRDNQ13061 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRDNQ13061 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRDNQ13061 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRDNQ13061 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRDNQ13061 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRDNQ13061 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRDNQ13061 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRDNQ13061 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRDNQ13061 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRDNQ13061 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRDNQ13061 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRDNQ13061 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRDNQ13061 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRDNQ13061 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRDNQ13061 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRDNQ13061 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRDNQ13061 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRDNQ13061 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRDNQ13061 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRDNQ13061 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRDNQ13061 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRDNQ13061 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRDNQ13061 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRDNQ13061 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRDNQ13061 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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