Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
PRDM2Q13029 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
PRDM2Q13029 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.42■■■■■ 5.82
PRDM2Q13029 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC51.41■■■■■ 5.82
PRDM2Q13029 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.36■■■■■ 5.81
PRDM2Q13029 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
PRDM2Q13029 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC51.25■■■■■ 5.8
PRDM2Q13029 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.22■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.21■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC51.21■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.2■■■■■ 5.79
PRDM2Q13029 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
PRDM2Q13029 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC51.12■■■■■ 5.77
PRDM2Q13029 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
PRDM2Q13029 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC51.07■■■■■ 5.77
PRDM2Q13029 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
PRDM2Q13029 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
PRDM2Q13029 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.95■■■■■ 5.75
PRDM2Q13029 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
PRDM2Q13029 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
PRDM2Q13029 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.91■■■■■ 5.74
PRDM2Q13029 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC50.85■■■■■ 5.73
PRDM2Q13029 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
PRDM2Q13029 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.81■■■■■ 5.72
PRDM2Q13029 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
PRDM2Q13029 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
PRDM2Q13029 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
PRDM2Q13029 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
PRDM2Q13029 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
PRDM2Q13029 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC50.69■■■■■ 5.71
PRDM2Q13029 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC50.64■■■■■ 5.7
PRDM2Q13029 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.69
PRDM2Q13029 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.55■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC50.5■■■■■ 5.68
PRDM2Q13029 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
PRDM2Q13029 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
PRDM2Q13029 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
PRDM2Q13029 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC50.45■■■■■ 5.67
PRDM2Q13029 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
PRDM2Q13029 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
PRDM2Q13029 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC50.37■■■■■ 5.65
PRDM2Q13029 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
PRDM2Q13029 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC50.31■■■■■ 5.64
PRDM2Q13029 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
PRDM2Q13029 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC50.28■■■■■ 5.64
PRDM2Q13029 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.64
PRDM2Q13029 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC50.25■■■■■ 5.63
PRDM2Q13029 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
PRDM2Q13029 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
PRDM2Q13029 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
PRDM2Q13029 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
PRDM2Q13029 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
PRDM2Q13029 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC50.06■■■■■ 5.6
PRDM2Q13029 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
PRDM2Q13029 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
PRDM2Q13029 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.59
PRDM2Q13029 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
PRDM2Q13029 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
PRDM2Q13029 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
PRDM2Q13029 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
PRDM2Q13029 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.56
PRDM2Q13029 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
PRDM2Q13029 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
PRDM2Q13029 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
PRDM2Q13029 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC49.59■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
PRDM2Q13029 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
PRDM2Q13029 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
PRDM2Q13029 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
PRDM2Q13029 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
PRDM2Q13029 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC49.54■■■■■ 5.52
PRDM2Q13029 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
PRDM2Q13029 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
PRDM2Q13029 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
PRDM2Q13029 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
PRDM2Q13029 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
PRDM2Q13029 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
PRDM2Q13029 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
PRDM2Q13029 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
PRDM2Q13029 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
PRDM2Q13029 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
PRDM2Q13029 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
PRDM2Q13029 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
PRDM2Q13029 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.47
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