Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DMPKQ09013 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DMPKQ09013 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DMPKQ09013 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DMPKQ09013 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DMPKQ09013 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DMPKQ09013 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DMPKQ09013 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DMPKQ09013 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DMPKQ09013 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DMPKQ09013 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DMPKQ09013 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DMPKQ09013 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DMPKQ09013 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DMPKQ09013 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DMPKQ09013 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DMPKQ09013 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DMPKQ09013 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DMPKQ09013 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DMPKQ09013 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DMPKQ09013 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DMPKQ09013 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DMPKQ09013 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DMPKQ09013 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DMPKQ09013 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DMPKQ09013 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DMPKQ09013 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DMPKQ09013 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DMPKQ09013 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DMPKQ09013 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DMPKQ09013 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DMPKQ09013 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DMPKQ09013 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DMPKQ09013 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DMPKQ09013 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DMPKQ09013 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DMPKQ09013 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DMPKQ09013 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DMPKQ09013 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DMPKQ09013 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DMPKQ09013 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DMPKQ09013 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DMPKQ09013 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DMPKQ09013 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DMPKQ09013 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DMPKQ09013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DMPKQ09013 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DMPKQ09013 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DMPKQ09013 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DMPKQ09013 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DMPKQ09013 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DMPKQ09013 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms