Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSBP1Q04837 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSBP1Q04837 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSBP1Q04837 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSBP1Q04837 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSBP1Q04837 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSBP1Q04837 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSBP1Q04837 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSBP1Q04837 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSBP1Q04837 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSBP1Q04837 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSBP1Q04837 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSBP1Q04837 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSBP1Q04837 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSBP1Q04837 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSBP1Q04837 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSBP1Q04837 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSBP1Q04837 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSBP1Q04837 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSBP1Q04837 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSBP1Q04837 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSBP1Q04837 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSBP1Q04837 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSBP1Q04837 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSBP1Q04837 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSBP1Q04837 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSBP1Q04837 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSBP1Q04837 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSBP1Q04837 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSBP1Q04837 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSBP1Q04837 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms