Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ATP7AQ04656 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ATP7AQ04656 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ATP7AQ04656 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ATP7AQ04656 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ATP7AQ04656 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ATP7AQ04656 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ATP7AQ04656 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ATP7AQ04656 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ATP7AQ04656 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ATP7AQ04656 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ATP7AQ04656 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
ATP7AQ04656 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
ATP7AQ04656 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ATP7AQ04656 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ATP7AQ04656 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ATP7AQ04656 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ATP7AQ04656 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ATP7AQ04656 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
ATP7AQ04656 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ATP7AQ04656 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ATP7AQ04656 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ATP7AQ04656 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ATP7AQ04656 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ATP7AQ04656 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
ATP7AQ04656 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ATP7AQ04656 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ATP7AQ04656 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
ATP7AQ04656 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ATP7AQ04656 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
ATP7AQ04656 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
ATP7AQ04656 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ATP7AQ04656 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ATP7AQ04656 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ATP7AQ04656 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ATP7AQ04656 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ATP7AQ04656 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ATP7AQ04656 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
ATP7AQ04656 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
ATP7AQ04656 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ATP7AQ04656 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
ATP7AQ04656 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ATP7AQ04656 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
ATP7AQ04656 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ATP7AQ04656 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ATP7AQ04656 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ATP7AQ04656 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
ATP7AQ04656 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ATP7AQ04656 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ATP7AQ04656 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ATP7AQ04656 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ATP7AQ04656 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ATP7AQ04656 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ATP7AQ04656 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ATP7AQ04656 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ATP7AQ04656 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ATP7AQ04656 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ATP7AQ04656 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ATP7AQ04656 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
ATP7AQ04656 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ATP7AQ04656 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ATP7AQ04656 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
ATP7AQ04656 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
ATP7AQ04656 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ATP7AQ04656 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ATP7AQ04656 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ATP7AQ04656 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ATP7AQ04656 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ATP7AQ04656 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ATP7AQ04656 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ATP7AQ04656 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
ATP7AQ04656 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ATP7AQ04656 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ATP7AQ04656 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
ATP7AQ04656 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATP7AQ04656 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ATP7AQ04656 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ATP7AQ04656 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms