Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPARDQ03181 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARDQ03181 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARDQ03181 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms