Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL18AQ02543 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL18AQ02543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL18AQ02543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL18AQ02543 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL18AQ02543 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL18AQ02543 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18AQ02543 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18AQ02543 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18AQ02543 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL18AQ02543 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL18AQ02543 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL18AQ02543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL18AQ02543 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL18AQ02543 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL18AQ02543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18AQ02543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18AQ02543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL18AQ02543 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18AQ02543 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms