Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TFAP4Q01664 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TFAP4Q01664 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TFAP4Q01664 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TFAP4Q01664 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TFAP4Q01664 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TFAP4Q01664 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TFAP4Q01664 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TFAP4Q01664 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TFAP4Q01664 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TFAP4Q01664 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TFAP4Q01664 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TFAP4Q01664 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TFAP4Q01664 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TFAP4Q01664 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TFAP4Q01664 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TFAP4Q01664 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TFAP4Q01664 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TFAP4Q01664 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TFAP4Q01664 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TFAP4Q01664 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TFAP4Q01664 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TFAP4Q01664 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TFAP4Q01664 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TFAP4Q01664 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TFAP4Q01664 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TFAP4Q01664 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TFAP4Q01664 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TFAP4Q01664 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TFAP4Q01664 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TFAP4Q01664 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TFAP4Q01664 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TFAP4Q01664 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TFAP4Q01664 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TFAP4Q01664 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TFAP4Q01664 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TFAP4Q01664 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TFAP4Q01664 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TFAP4Q01664 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TFAP4Q01664 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TFAP4Q01664 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TFAP4Q01664 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TFAP4Q01664 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TFAP4Q01664 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TFAP4Q01664 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TFAP4Q01664 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TFAP4Q01664 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TFAP4Q01664 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TFAP4Q01664 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TFAP4Q01664 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TFAP4Q01664 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TFAP4Q01664 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TFAP4Q01664 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TFAP4Q01664 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TFAP4Q01664 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TFAP4Q01664 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms