Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL20P78556 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL20P78556 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL20P78556 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL20P78556 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL20P78556 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL20P78556 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL20P78556 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL20P78556 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL20P78556 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL20P78556 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL20P78556 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL20P78556 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL20P78556 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL20P78556 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL20P78556 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL20P78556 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL20P78556 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL20P78556 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL20P78556 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL20P78556 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL20P78556 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL20P78556 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL20P78556 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL20P78556 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL20P78556 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL20P78556 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL20P78556 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL20P78556 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL20P78556 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL20P78556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL20P78556 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL20P78556 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL20P78556 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL20P78556 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL20P78556 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL20P78556 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL20P78556 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL20P78556 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL20P78556 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL20P78556 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL20P78556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL20P78556 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL20P78556 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL20P78556 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL20P78556 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL20P78556 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL20P78556 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL20P78556 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL20P78556 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL20P78556 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL20P78556 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL20P78556 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL20P78556 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL20P78556 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL20P78556 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL20P78556 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL20P78556 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL20P78556 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL20P78556 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL20P78556 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL20P78556 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL20P78556 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL20P78556 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL20P78556 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL20P78556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL20P78556 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL20P78556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL20P78556 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL20P78556 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL20P78556 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL20P78556 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL20P78556 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL20P78556 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL20P78556 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL20P78556 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL20P78556 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL20P78556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL20P78556 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL20P78556 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL20P78556 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL20P78556 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL20P78556 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL20P78556 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL20P78556 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL20P78556 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL20P78556 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL20P78556 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL20P78556 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL20P78556 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL20P78556 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL20P78556 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL20P78556 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL20P78556 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL20P78556 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL20P78556 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL20P78556 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL20P78556 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL20P78556 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL20P78556 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms