Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPXP78539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPXP78539 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPXP78539 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPXP78539 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPXP78539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPXP78539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPXP78539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPXP78539 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPXP78539 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPXP78539 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPXP78539 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPXP78539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPXP78539 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPXP78539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPXP78539 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPXP78539 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPXP78539 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPXP78539 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPXP78539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPXP78539 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPXP78539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPXP78539 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPXP78539 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPXP78539 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPXP78539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPXP78539 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPXP78539 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPXP78539 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPXP78539 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPXP78539 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPXP78539 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPXP78539 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPXP78539 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPXP78539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPXP78539 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPXP78539 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPXP78539 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPXP78539 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPXP78539 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPXP78539 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPXP78539 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPXP78539 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPXP78539 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPXP78539 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPXP78539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPXP78539 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPXP78539 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPXP78539 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPXP78539 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPXP78539 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPXP78539 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPXP78539 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPXP78539 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPXP78539 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPXP78539 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPXP78539 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPXP78539 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPXP78539 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPXP78539 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPXP78539 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPXP78539 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPXP78539 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPXP78539 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPXP78539 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPXP78539 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPXP78539 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPXP78539 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPXP78539 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPXP78539 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPXP78539 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPXP78539 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPXP78539 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPXP78539 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPXP78539 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPXP78539 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPXP78539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPXP78539 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPXP78539 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPXP78539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPXP78539 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPXP78539 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPXP78539 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPXP78539 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPXP78539 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPXP78539 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPXP78539 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPXP78539 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPXP78539 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPXP78539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPXP78539 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPXP78539 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPXP78539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPXP78539 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPXP78539 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPXP78539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPXP78539 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPXP78539 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPXP78539 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPXP78539 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms