Protein–RNA interactions for Protein: P78346

RPP30, Ribonuclease P protein subunit p30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP30P78346 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP30P78346 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP30P78346 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP30P78346 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP30P78346 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP30P78346 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP30P78346 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP30P78346 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP30P78346 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP30P78346 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPP30P78346 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPP30P78346 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPP30P78346 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPP30P78346 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPP30P78346 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPP30P78346 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPP30P78346 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPP30P78346 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPP30P78346 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPP30P78346 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPP30P78346 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPP30P78346 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPP30P78346 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPP30P78346 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPP30P78346 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPP30P78346 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPP30P78346 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPP30P78346 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPP30P78346 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPP30P78346 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPP30P78346 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP30P78346 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP30P78346 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP30P78346 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP30P78346 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP30P78346 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP30P78346 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP30P78346 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP30P78346 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP30P78346 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP30P78346 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP30P78346 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP30P78346 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP30P78346 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP30P78346 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP30P78346 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP30P78346 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP30P78346 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP30P78346 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP30P78346 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP30P78346 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP30P78346 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP30P78346 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP30P78346 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP30P78346 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP30P78346 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP30P78346 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP30P78346 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP30P78346 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPP30P78346 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPP30P78346 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPP30P78346 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPP30P78346 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPP30P78346 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPP30P78346 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPP30P78346 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPP30P78346 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPP30P78346 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPP30P78346 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPP30P78346 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPP30P78346 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPP30P78346 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPP30P78346 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPP30P78346 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPP30P78346 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPP30P78346 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPP30P78346 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPP30P78346 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPP30P78346 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPP30P78346 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPP30P78346 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPP30P78346 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPP30P78346 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPP30P78346 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPP30P78346 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPP30P78346 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPP30P78346 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPP30P78346 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPP30P78346 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPP30P78346 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPP30P78346 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPP30P78346 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPP30P78346 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPP30P78346 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPP30P78346 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPP30P78346 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPP30P78346 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPP30P78346 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPP30P78346 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPP30P78346 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms