Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HBBP68871 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBBP68871 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBBP68871 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBBP68871 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBBP68871 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBBP68871 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBBP68871 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBBP68871 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBBP68871 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBBP68871 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBBP68871 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBBP68871 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBBP68871 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBBP68871 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBBP68871 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HBBP68871 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBBP68871 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBBP68871 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBBP68871 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBBP68871 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBBP68871 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBBP68871 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBBP68871 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HBBP68871 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HBBP68871 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBBP68871 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBBP68871 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBBP68871 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBBP68871 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBBP68871 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBBP68871 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBBP68871 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBBP68871 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBBP68871 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBBP68871 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBBP68871 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBBP68871 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HBBP68871 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HBBP68871 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HBBP68871 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HBBP68871 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HBBP68871 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBBP68871 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBBP68871 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HBBP68871 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HBBP68871 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBBP68871 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBBP68871 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBBP68871 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBBP68871 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBBP68871 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBBP68871 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBBP68871 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBBP68871 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBBP68871 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBBP68871 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBBP68871 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HBBP68871 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HBBP68871 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBBP68871 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HBBP68871 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBBP68871 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBBP68871 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBBP68871 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBBP68871 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBBP68871 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBBP68871 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBBP68871 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBBP68871 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBBP68871 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBBP68871 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBBP68871 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBBP68871 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBBP68871 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBBP68871 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBBP68871 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBBP68871 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HBBP68871 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HBBP68871 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HBBP68871 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HBBP68871 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HBBP68871 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HBBP68871 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HBBP68871 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HBBP68871 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBBP68871 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HBBP68871 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HBBP68871 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HBBP68871 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HBBP68871 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HBBP68871 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HBBP68871 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBBP68871 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBBP68871 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms