Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBXN2AP68543 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBXN2AP68543 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBXN2AP68543 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBXN2AP68543 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
UBXN2AP68543 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBXN2AP68543 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBXN2AP68543 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UBXN2AP68543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UBXN2AP68543 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UBXN2AP68543 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBXN2AP68543 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBXN2AP68543 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
UBXN2AP68543 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBXN2AP68543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBXN2AP68543 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBXN2AP68543 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBXN2AP68543 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBXN2AP68543 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBXN2AP68543 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBXN2AP68543 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
UBXN2AP68543 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBXN2AP68543 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBXN2AP68543 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBXN2AP68543 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBXN2AP68543 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
UBXN2AP68543 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBXN2AP68543 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
UBXN2AP68543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
UBXN2AP68543 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
UBXN2AP68543 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBXN2AP68543 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
UBXN2AP68543 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBXN2AP68543 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
UBXN2AP68543 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
UBXN2AP68543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
UBXN2AP68543 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UBXN2AP68543 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBXN2AP68543 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
UBXN2AP68543 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
UBXN2AP68543 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBXN2AP68543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBXN2AP68543 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBXN2AP68543 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UBXN2AP68543 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
UBXN2AP68543 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
UBXN2AP68543 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
UBXN2AP68543 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBXN2AP68543 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBXN2AP68543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
UBXN2AP68543 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBXN2AP68543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
UBXN2AP68543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms