Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTG1P63261 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTG1P63261 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTG1P63261 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTG1P63261 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTG1P63261 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTG1P63261 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTG1P63261 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTG1P63261 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTG1P63261 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTG1P63261 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTG1P63261 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTG1P63261 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTG1P63261 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTG1P63261 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTG1P63261 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTG1P63261 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTG1P63261 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTG1P63261 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTG1P63261 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTG1P63261 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTG1P63261 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTG1P63261 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTG1P63261 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTG1P63261 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTG1P63261 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTG1P63261 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTG1P63261 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms