Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERVK_113P63121 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63121 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERVK_113P63121 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P63121 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63121 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P63121 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERVK_113P63121 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63121 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63121 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P63121 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms