Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS16P62249 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS16P62249 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS16P62249 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS16P62249 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS16P62249 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS16P62249 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS16P62249 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS16P62249 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS16P62249 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS16P62249 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS16P62249 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS16P62249 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS16P62249 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS16P62249 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS16P62249 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS16P62249 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS16P62249 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS16P62249 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS16P62249 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS16P62249 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS16P62249 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS16P62249 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS16P62249 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS16P62249 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS16P62249 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS16P62249 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS16P62249 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS16P62249 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS16P62249 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS16P62249 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS16P62249 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS16P62249 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS16P62249 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS16P62249 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS16P62249 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS16P62249 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS16P62249 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS16P62249 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS16P62249 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS16P62249 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS16P62249 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS16P62249 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS16P62249 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS16P62249 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS16P62249 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS16P62249 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS16P62249 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS16P62249 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS16P62249 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS16P62249 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS16P62249 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS16P62249 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS16P62249 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS16P62249 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS16P62249 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS16P62249 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS16P62249 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS16P62249 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS16P62249 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS16P62249 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS16P62249 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS16P62249 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS16P62249 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS16P62249 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS16P62249 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS16P62249 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS16P62249 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS16P62249 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS16P62249 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS16P62249 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS16P62249 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS16P62249 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS16P62249 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS16P62249 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS16P62249 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS16P62249 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS16P62249 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS16P62249 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS16P62249 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS16P62249 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS16P62249 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS16P62249 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS16P62249 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS16P62249 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS16P62249 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS16P62249 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS16P62249 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS16P62249 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS16P62249 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS16P62249 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS16P62249 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS16P62249 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS16P62249 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS16P62249 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS16P62249 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS16P62249 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS16P62249 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS16P62249 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS16P62249 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms