Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN5P62079 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN5P62079 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN5P62079 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN5P62079 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN5P62079 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN5P62079 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN5P62079 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN5P62079 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN5P62079 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN5P62079 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN5P62079 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN5P62079 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN5P62079 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN5P62079 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN5P62079 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN5P62079 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN5P62079 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN5P62079 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN5P62079 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN5P62079 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN5P62079 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN5P62079 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN5P62079 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN5P62079 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN5P62079 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN5P62079 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN5P62079 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN5P62079 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN5P62079 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN5P62079 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN5P62079 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN5P62079 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN5P62079 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN5P62079 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN5P62079 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms