Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P61574 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P61574 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P61574 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P61574 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P61574 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P61574 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P61574 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P61574 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P61574 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P61574 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P61574 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P61574 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P61574 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P61574 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113P61574 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERVK_113P61574 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P61574 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms