Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTR3P61158 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTR3P61158 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTR3P61158 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTR3P61158 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTR3P61158 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTR3P61158 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTR3P61158 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTR3P61158 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ACTR3P61158 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTR3P61158 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTR3P61158 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTR3P61158 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTR3P61158 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTR3P61158 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTR3P61158 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTR3P61158 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTR3P61158 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTR3P61158 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTR3P61158 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ACTR3P61158 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTR3P61158 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTR3P61158 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTR3P61158 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ACTR3P61158 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTR3P61158 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTR3P61158 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTR3P61158 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTR3P61158 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACTR3P61158 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTR3P61158 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTR3P61158 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTR3P61158 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTR3P61158 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTR3P61158 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTR3P61158 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTR3P61158 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTR3P61158 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTR3P61158 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTR3P61158 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTR3P61158 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTR3P61158 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTR3P61158 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR3P61158 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTR3P61158 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTR3P61158 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACTR3P61158 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTR3P61158 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTR3P61158 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTR3P61158 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTR3P61158 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTR3P61158 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTR3P61158 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTR3P61158 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTR3P61158 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTR3P61158 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTR3P61158 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTR3P61158 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms