Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GMFBP60983 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GMFBP60983 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMFBP60983 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMFBP60983 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMFBP60983 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GMFBP60983 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GMFBP60983 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GMFBP60983 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GMFBP60983 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMFBP60983 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GMFBP60983 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GMFBP60983 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GMFBP60983 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GMFBP60983 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMFBP60983 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMFBP60983 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMFBP60983 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GMFBP60983 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMFBP60983 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMFBP60983 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GMFBP60983 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GMFBP60983 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GMFBP60983 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GMFBP60983 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GMFBP60983 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GMFBP60983 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMFBP60983 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GMFBP60983 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GMFBP60983 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GMFBP60983 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMFBP60983 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMFBP60983 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GMFBP60983 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMFBP60983 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GMFBP60983 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMFBP60983 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GMFBP60983 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMFBP60983 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GMFBP60983 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GMFBP60983 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GMFBP60983 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMFBP60983 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMFBP60983 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFBP60983 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFBP60983 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMFBP60983 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMFBP60983 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMFBP60983 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GMFBP60983 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMFBP60983 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMFBP60983 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMFBP60983 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMFBP60983 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GMFBP60983 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFBP60983 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFBP60983 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFBP60983 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMFBP60983 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMFBP60983 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMFBP60983 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMFBP60983 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMFBP60983 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMFBP60983 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMFBP60983 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFBP60983 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMFBP60983 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFBP60983 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFBP60983 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMFBP60983 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMFBP60983 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMFBP60983 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMFBP60983 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMFBP60983 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMFBP60983 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMFBP60983 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFBP60983 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMFBP60983 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFBP60983 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFBP60983 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFBP60983 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFBP60983 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMFBP60983 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMFBP60983 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMFBP60983 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMFBP60983 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMFBP60983 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMFBP60983 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMFBP60983 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMFBP60983 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GMFBP60983 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GMFBP60983 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GMFBP60983 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GMFBP60983 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMFBP60983 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMFBP60983 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMFBP60983 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMFBP60983 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMFBP60983 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMFBP60983 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms