Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFB1P60022 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFB1P60022 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFB1P60022 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFB1P60022 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFB1P60022 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFB1P60022 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFB1P60022 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFB1P60022 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB1P60022 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB1P60022 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFB1P60022 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFB1P60022 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFB1P60022 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DEFB1P60022 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFB1P60022 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFB1P60022 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEFB1P60022 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFB1P60022 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFB1P60022 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFB1P60022 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFB1P60022 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFB1P60022 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFB1P60022 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFB1P60022 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFB1P60022 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFB1P60022 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms