Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN8P56748 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN8P56748 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN8P56748 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN8P56748 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN8P56748 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN8P56748 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN8P56748 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN8P56748 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN8P56748 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN8P56748 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN8P56748 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN8P56748 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN8P56748 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN8P56748 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN8P56748 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN8P56748 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN8P56748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN8P56748 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN8P56748 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN8P56748 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN8P56748 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN8P56748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN8P56748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN8P56748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN8P56748 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN8P56748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN8P56748 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN8P56748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLDN8P56748 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN8P56748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN8P56748 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN8P56748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN8P56748 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms