Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH11P55287 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH11P55287 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH11P55287 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH11P55287 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH11P55287 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDH11P55287 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH11P55287 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH11P55287 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH11P55287 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH11P55287 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH11P55287 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH11P55287 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH11P55287 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH11P55287 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH11P55287 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH11P55287 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH11P55287 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH11P55287 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH11P55287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH11P55287 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH11P55287 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH11P55287 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH11P55287 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH11P55287 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH11P55287 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH11P55287 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH11P55287 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH11P55287 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH11P55287 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH11P55287 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH11P55287 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH11P55287 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH11P55287 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH11P55287 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH11P55287 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH11P55287 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH11P55287 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH11P55287 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH11P55287 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH11P55287 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH11P55287 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH11P55287 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH11P55287 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH11P55287 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH11P55287 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH11P55287 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH11P55287 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH11P55287 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH11P55287 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH11P55287 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH11P55287 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH11P55287 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH11P55287 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH11P55287 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH11P55287 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH11P55287 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH11P55287 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH11P55287 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH11P55287 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH11P55287 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH11P55287 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH11P55287 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH11P55287 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH11P55287 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH11P55287 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH11P55287 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH11P55287 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH11P55287 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH11P55287 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH11P55287 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH11P55287 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH11P55287 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH11P55287 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH11P55287 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH11P55287 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH11P55287 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH11P55287 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH11P55287 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH11P55287 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH11P55287 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH11P55287 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH11P55287 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH11P55287 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH11P55287 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH11P55287 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH11P55287 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH11P55287 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH11P55287 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH11P55287 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH11P55287 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH11P55287 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH11P55287 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH11P55287 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH11P55287 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDH11P55287 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDH11P55287 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH11P55287 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH11P55287 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH11P55287 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms