Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN3P54252 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN3P54252 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATXN3P54252 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATXN3P54252 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATXN3P54252 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN3P54252 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATXN3P54252 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATXN3P54252 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATXN3P54252 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN3P54252 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN3P54252 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATXN3P54252 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATXN3P54252 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN3P54252 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATXN3P54252 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATXN3P54252 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATXN3P54252 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN3P54252 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATXN3P54252 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN3P54252 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN3P54252 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN3P54252 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN3P54252 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATXN3P54252 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN3P54252 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN3P54252 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN3P54252 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN3P54252 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN3P54252 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN3P54252 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN3P54252 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATXN3P54252 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN3P54252 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN3P54252 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN3P54252 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN3P54252 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATXN3P54252 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN3P54252 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATXN3P54252 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN3P54252 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN3P54252 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms