Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
COPAP53621 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COPAP53621 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COPAP53621 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COPAP53621 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COPAP53621 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COPAP53621 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COPAP53621 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COPAP53621 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COPAP53621 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COPAP53621 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COPAP53621 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COPAP53621 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COPAP53621 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COPAP53621 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COPAP53621 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COPAP53621 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
COPAP53621 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COPAP53621 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COPAP53621 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COPAP53621 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COPAP53621 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COPAP53621 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COPAP53621 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COPAP53621 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COPAP53621 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COPAP53621 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPAP53621 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COPAP53621 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COPAP53621 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COPAP53621 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COPAP53621 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COPAP53621 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COPAP53621 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COPAP53621 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COPAP53621 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COPAP53621 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPAP53621 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPAP53621 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPAP53621 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPAP53621 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPAP53621 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPAP53621 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPAP53621 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPAP53621 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPAP53621 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPAP53621 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPAP53621 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPAP53621 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPAP53621 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COPAP53621 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPAP53621 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPAP53621 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPAP53621 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COPAP53621 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COPAP53621 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPAP53621 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COPAP53621 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COPAP53621 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COPAP53621 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPAP53621 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPAP53621 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPAP53621 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPAP53621 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COPAP53621 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPAP53621 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COPAP53621 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COPAP53621 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COPAP53621 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPAP53621 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPAP53621 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPAP53621 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPAP53621 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPAP53621 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPAP53621 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COPAP53621 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COPAP53621 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPAP53621 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPAP53621 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPAP53621 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPAP53621 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COPAP53621 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COPAP53621 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COPAP53621 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COPAP53621 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COPAP53621 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPAP53621 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COPAP53621 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPAP53621 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPAP53621 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPAP53621 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPAP53621 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPAP53621 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COPAP53621 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPAP53621 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPAP53621 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COPAP53621 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COPAP53621 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COPAP53621 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COPAP53621 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms