Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MTHFSP49914 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
MTHFSP49914 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
MTHFSP49914 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
MTHFSP49914 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
MTHFSP49914 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MTHFSP49914 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MTHFSP49914 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
MTHFSP49914 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MTHFSP49914 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MTHFSP49914 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
MTHFSP49914 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
MTHFSP49914 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
MTHFSP49914 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
MTHFSP49914 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
MTHFSP49914 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
MTHFSP49914 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
MTHFSP49914 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MTHFSP49914 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MTHFSP49914 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
MTHFSP49914 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
MTHFSP49914 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MTHFSP49914 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MTHFSP49914 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MTHFSP49914 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
MTHFSP49914 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
MTHFSP49914 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
MTHFSP49914 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
MTHFSP49914 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
MTHFSP49914 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
MTHFSP49914 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MTHFSP49914 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MTHFSP49914 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MTHFSP49914 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MTHFSP49914 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MTHFSP49914 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MTHFSP49914 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
MTHFSP49914 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MTHFSP49914 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MTHFSP49914 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
MTHFSP49914 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
MTHFSP49914 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
MTHFSP49914 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
MTHFSP49914 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MTHFSP49914 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MTHFSP49914 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MTHFSP49914 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MTHFSP49914 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MTHFSP49914 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
MTHFSP49914 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MTHFSP49914 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
MTHFSP49914 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MTHFSP49914 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MTHFSP49914 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MTHFSP49914 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MTHFSP49914 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MTHFSP49914 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MTHFSP49914 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
MTHFSP49914 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MTHFSP49914 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MTHFSP49914 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MTHFSP49914 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
MTHFSP49914 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MTHFSP49914 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MTHFSP49914 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MTHFSP49914 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MTHFSP49914 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MTHFSP49914 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MTHFSP49914 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
MTHFSP49914 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MTHFSP49914 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms