Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSK3AP49840 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSK3AP49840 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSK3AP49840 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSK3AP49840 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSK3AP49840 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSK3AP49840 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSK3AP49840 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSK3AP49840 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSK3AP49840 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSK3AP49840 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3AP49840 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3AP49840 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3AP49840 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSK3AP49840 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSK3AP49840 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSK3AP49840 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSK3AP49840 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSK3AP49840 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSK3AP49840 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSK3AP49840 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSK3AP49840 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3AP49840 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3AP49840 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSK3AP49840 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSK3AP49840 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3AP49840 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSK3AP49840 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSK3AP49840 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms