Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK1P49759 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLK1P49759 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLK1P49759 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLK1P49759 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLK1P49759 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK1P49759 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK1P49759 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK1P49759 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK1P49759 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK1P49759 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK1P49759 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLK1P49759 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLK1P49759 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLK1P49759 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLK1P49759 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLK1P49759 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLK1P49759 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLK1P49759 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLK1P49759 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLK1P49759 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK1P49759 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK1P49759 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK1P49759 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLK1P49759 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK1P49759 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK1P49759 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK1P49759 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLK1P49759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLK1P49759 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK1P49759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK1P49759 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLK1P49759 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLK1P49759 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLK1P49759 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK1P49759 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK1P49759 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK1P49759 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLK1P49759 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK1P49759 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK1P49759 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK1P49759 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK1P49759 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLK1P49759 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLK1P49759 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLK1P49759 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLK1P49759 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLK1P49759 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLK1P49759 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLK1P49759 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK1P49759 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK1P49759 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLK1P49759 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLK1P49759 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLK1P49759 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK1P49759 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK1P49759 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK1P49759 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK1P49759 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK1P49759 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK1P49759 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK1P49759 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK1P49759 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK1P49759 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK1P49759 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK1P49759 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK1P49759 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK1P49759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK1P49759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK1P49759 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK1P49759 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK1P49759 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK1P49759 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK1P49759 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK1P49759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK1P49759 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK1P49759 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK1P49759 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK1P49759 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK1P49759 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK1P49759 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLK1P49759 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK1P49759 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK1P49759 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK1P49759 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK1P49759 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK1P49759 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK1P49759 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK1P49759 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK1P49759 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK1P49759 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK1P49759 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK1P49759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK1P49759 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK1P49759 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK1P49759 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK1P49759 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK1P49759 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK1P49759 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK1P49759 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms