Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CENPFP49454 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPFP49454 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPFP49454 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPFP49454 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPFP49454 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPFP49454 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CENPFP49454 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPFP49454 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPFP49454 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPFP49454 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPFP49454 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CENPFP49454 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPFP49454 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CENPFP49454 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CENPFP49454 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPFP49454 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CENPFP49454 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CENPFP49454 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPFP49454 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPFP49454 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPFP49454 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPFP49454 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CENPFP49454 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPFP49454 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPFP49454 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPFP49454 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPFP49454 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPFP49454 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPFP49454 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPFP49454 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPFP49454 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPFP49454 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPFP49454 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPFP49454 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPFP49454 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPFP49454 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPFP49454 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPFP49454 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPFP49454 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPFP49454 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPFP49454 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPFP49454 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPFP49454 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPFP49454 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPFP49454 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPFP49454 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPFP49454 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPFP49454 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPFP49454 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPFP49454 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPFP49454 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPFP49454 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPFP49454 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPFP49454 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPFP49454 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPFP49454 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPFP49454 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CENPFP49454 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CENPFP49454 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CENPFP49454 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CENPFP49454 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPFP49454 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CENPFP49454 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CENPFP49454 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPFP49454 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPFP49454 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPFP49454 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CENPFP49454 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CENPFP49454 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CENPFP49454 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CENPFP49454 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPFP49454 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CENPFP49454 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CENPFP49454 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPFP49454 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPFP49454 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CENPFP49454 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CENPFP49454 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CENPFP49454 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CENPFP49454 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CENPFP49454 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CENPFP49454 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CENPFP49454 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CENPFP49454 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CENPFP49454 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CENPFP49454 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CENPFP49454 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPFP49454 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPFP49454 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPFP49454 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPFP49454 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPFP49454 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPFP49454 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPFP49454 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPFP49454 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPFP49454 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPFP49454 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPFP49454 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPFP49454 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
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