Protein–RNA interactions for Protein: P48549

KCNJ3, G protein-activated inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ3P48549 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNJ3P48549 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ3P48549 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNJ3P48549 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNJ3P48549 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ3P48549 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNJ3P48549 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNJ3P48549 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNJ3P48549 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNJ3P48549 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNJ3P48549 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNJ3P48549 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNJ3P48549 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNJ3P48549 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNJ3P48549 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNJ3P48549 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNJ3P48549 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNJ3P48549 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNJ3P48549 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNJ3P48549 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNJ3P48549 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ3P48549 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNJ3P48549 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNJ3P48549 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNJ3P48549 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNJ3P48549 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNJ3P48549 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms