Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL29P47914 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL29P47914 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL29P47914 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL29P47914 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL29P47914 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL29P47914 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL29P47914 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL29P47914 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL29P47914 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL29P47914 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL29P47914 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL29P47914 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL29P47914 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL29P47914 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL29P47914 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL29P47914 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL29P47914 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL29P47914 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL29P47914 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL29P47914 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL29P47914 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL29P47914 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL29P47914 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL29P47914 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL29P47914 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL29P47914 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL29P47914 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL29P47914 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL29P47914 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL29P47914 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL29P47914 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL29P47914 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL29P47914 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL29P47914 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL29P47914 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL29P47914 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL29P47914 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL29P47914 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL29P47914 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL29P47914 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL29P47914 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL29P47914 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL29P47914 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL29P47914 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL29P47914 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL29P47914 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL29P47914 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL29P47914 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL29P47914 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL29P47914 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL29P47914 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL29P47914 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL29P47914 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL29P47914 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL29P47914 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL29P47914 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL29P47914 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL29P47914 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL29P47914 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL29P47914 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL29P47914 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL29P47914 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL29P47914 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL29P47914 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL29P47914 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL29P47914 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL29P47914 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL29P47914 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL29P47914 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL29P47914 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL29P47914 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL29P47914 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL29P47914 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL29P47914 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL29P47914 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL29P47914 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL29P47914 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL29P47914 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL29P47914 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL29P47914 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL29P47914 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL29P47914 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL29P47914 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL29P47914 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL29P47914 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL29P47914 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL29P47914 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL29P47914 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL29P47914 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL29P47914 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL29P47914 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL29P47914 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL29P47914 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL29P47914 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL29P47914 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL29P47914 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL29P47914 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL29P47914 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL29P47914 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms