Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNOSP40205 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNOSP40205 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNOSP40205 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNOSP40205 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYCNOSP40205 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYCNOSP40205 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNOSP40205 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNOSP40205 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNOSP40205 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYCNOSP40205 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNOSP40205 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNOSP40205 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNOSP40205 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYCNOSP40205 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNOSP40205 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNOSP40205 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCNOSP40205 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms