Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDNFP39905 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDNFP39905 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDNFP39905 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDNFP39905 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDNFP39905 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDNFP39905 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDNFP39905 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDNFP39905 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDNFP39905 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDNFP39905 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDNFP39905 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDNFP39905 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDNFP39905 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDNFP39905 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDNFP39905 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDNFP39905 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDNFP39905 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDNFP39905 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDNFP39905 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDNFP39905 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDNFP39905 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDNFP39905 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDNFP39905 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDNFP39905 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDNFP39905 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDNFP39905 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDNFP39905 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDNFP39905 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDNFP39905 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDNFP39905 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDNFP39905 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDNFP39905 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDNFP39905 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDNFP39905 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDNFP39905 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDNFP39905 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDNFP39905 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDNFP39905 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDNFP39905 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDNFP39905 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GDNFP39905 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDNFP39905 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDNFP39905 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDNFP39905 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDNFP39905 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDNFP39905 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDNFP39905 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDNFP39905 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDNFP39905 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDNFP39905 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDNFP39905 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDNFP39905 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDNFP39905 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDNFP39905 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDNFP39905 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDNFP39905 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDNFP39905 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDNFP39905 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDNFP39905 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDNFP39905 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GDNFP39905 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDNFP39905 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDNFP39905 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDNFP39905 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDNFP39905 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDNFP39905 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDNFP39905 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDNFP39905 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDNFP39905 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDNFP39905 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDNFP39905 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDNFP39905 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDNFP39905 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDNFP39905 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDNFP39905 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDNFP39905 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDNFP39905 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDNFP39905 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDNFP39905 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDNFP39905 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDNFP39905 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDNFP39905 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDNFP39905 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDNFP39905 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDNFP39905 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDNFP39905 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDNFP39905 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDNFP39905 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDNFP39905 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDNFP39905 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDNFP39905 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDNFP39905 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDNFP39905 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDNFP39905 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDNFP39905 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDNFP39905 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDNFP39905 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDNFP39905 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDNFP39905 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms