Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX11P35716 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX11P35716 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX11P35716 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX11P35716 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX11P35716 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX11P35716 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX11P35716 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX11P35716 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOX11P35716 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX11P35716 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX11P35716 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX11P35716 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX11P35716 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX11P35716 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX11P35716 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX11P35716 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX11P35716 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX11P35716 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX11P35716 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX11P35716 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX11P35716 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX11P35716 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX11P35716 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX11P35716 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX11P35716 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX11P35716 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOX11P35716 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX11P35716 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX11P35716 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SOX11P35716 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX11P35716 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX11P35716 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX11P35716 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX11P35716 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX11P35716 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX11P35716 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX11P35716 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX11P35716 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX11P35716 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX11P35716 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX11P35716 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX11P35716 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX11P35716 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX11P35716 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX11P35716 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX11P35716 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX11P35716 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX11P35716 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX11P35716 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX11P35716 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX11P35716 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX11P35716 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX11P35716 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX11P35716 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX11P35716 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX11P35716 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX11P35716 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX11P35716 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX11P35716 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX11P35716 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX11P35716 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX11P35716 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX11P35716 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX11P35716 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX11P35716 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX11P35716 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX11P35716 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX11P35716 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX11P35716 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX11P35716 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX11P35716 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX11P35716 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX11P35716 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX11P35716 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX11P35716 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX11P35716 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX11P35716 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX11P35716 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX11P35716 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX11P35716 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX11P35716 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX11P35716 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX11P35716 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX11P35716 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX11P35716 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX11P35716 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX11P35716 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX11P35716 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX11P35716 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX11P35716 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX11P35716 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX11P35716 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX11P35716 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX11P35716 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX11P35716 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX11P35716 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX11P35716 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX11P35716 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX11P35716 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms