Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THBS4P35443 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THBS4P35443 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THBS4P35443 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THBS4P35443 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
THBS4P35443 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THBS4P35443 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
THBS4P35443 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THBS4P35443 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THBS4P35443 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THBS4P35443 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THBS4P35443 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THBS4P35443 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THBS4P35443 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THBS4P35443 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THBS4P35443 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THBS4P35443 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THBS4P35443 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
THBS4P35443 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THBS4P35443 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THBS4P35443 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THBS4P35443 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THBS4P35443 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THBS4P35443 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THBS4P35443 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THBS4P35443 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS4P35443 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS4P35443 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS4P35443 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS4P35443 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS4P35443 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THBS4P35443 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THBS4P35443 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THBS4P35443 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THBS4P35443 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THBS4P35443 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THBS4P35443 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THBS4P35443 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THBS4P35443 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THBS4P35443 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THBS4P35443 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THBS4P35443 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THBS4P35443 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS4P35443 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS4P35443 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THBS4P35443 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THBS4P35443 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THBS4P35443 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THBS4P35443 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THBS4P35443 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THBS4P35443 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THBS4P35443 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THBS4P35443 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THBS4P35443 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THBS4P35443 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THBS4P35443 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THBS4P35443 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THBS4P35443 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THBS4P35443 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THBS4P35443 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THBS4P35443 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THBS4P35443 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THBS4P35443 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THBS4P35443 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THBS4P35443 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS4P35443 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS4P35443 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS4P35443 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THBS4P35443 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THBS4P35443 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THBS4P35443 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THBS4P35443 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THBS4P35443 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THBS4P35443 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THBS4P35443 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS4P35443 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS4P35443 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS4P35443 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS4P35443 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS4P35443 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THBS4P35443 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THBS4P35443 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THBS4P35443 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THBS4P35443 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THBS4P35443 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THBS4P35443 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS4P35443 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THBS4P35443 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THBS4P35443 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS4P35443 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS4P35443 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS4P35443 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS4P35443 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS4P35443 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS4P35443 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THBS4P35443 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS4P35443 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS4P35443 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS4P35443 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS4P35443 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms