Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSP1P33241 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LSP1P33241 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSP1P33241 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSP1P33241 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSP1P33241 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSP1P33241 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSP1P33241 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSP1P33241 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSP1P33241 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSP1P33241 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSP1P33241 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSP1P33241 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSP1P33241 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSP1P33241 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSP1P33241 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSP1P33241 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSP1P33241 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSP1P33241 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSP1P33241 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSP1P33241 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSP1P33241 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSP1P33241 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSP1P33241 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSP1P33241 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSP1P33241 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSP1P33241 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSP1P33241 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LSP1P33241 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSP1P33241 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSP1P33241 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSP1P33241 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSP1P33241 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSP1P33241 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSP1P33241 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSP1P33241 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSP1P33241 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSP1P33241 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LSP1P33241 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LSP1P33241 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSP1P33241 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSP1P33241 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSP1P33241 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LSP1P33241 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LSP1P33241 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSP1P33241 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSP1P33241 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSP1P33241 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSP1P33241 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSP1P33241 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSP1P33241 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LSP1P33241 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSP1P33241 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSP1P33241 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSP1P33241 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSP1P33241 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LSP1P33241 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSP1P33241 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSP1P33241 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSP1P33241 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSP1P33241 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSP1P33241 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSP1P33241 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSP1P33241 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSP1P33241 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSP1P33241 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSP1P33241 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSP1P33241 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSP1P33241 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSP1P33241 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSP1P33241 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSP1P33241 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSP1P33241 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSP1P33241 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSP1P33241 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSP1P33241 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSP1P33241 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSP1P33241 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSP1P33241 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSP1P33241 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSP1P33241 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LSP1P33241 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LSP1P33241 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSP1P33241 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSP1P33241 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LSP1P33241 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSP1P33241 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSP1P33241 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSP1P33241 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSP1P33241 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSP1P33241 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSP1P33241 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LSP1P33241 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSP1P33241 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSP1P33241 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSP1P33241 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSP1P33241 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSP1P33241 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSP1P33241 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSP1P33241 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 821.1 ms