Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GBP1P32455 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GBP1P32455 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GBP1P32455 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GBP1P32455 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GBP1P32455 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GBP1P32455 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP1P32455 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP1P32455 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP1P32455 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GBP1P32455 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GBP1P32455 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP1P32455 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP1P32455 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP1P32455 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GBP1P32455 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GBP1P32455 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GBP1P32455 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP1P32455 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP1P32455 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP1P32455 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP1P32455 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP1P32455 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP1P32455 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP1P32455 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP1P32455 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GBP1P32455 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GBP1P32455 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GBP1P32455 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GBP1P32455 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP1P32455 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP1P32455 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP1P32455 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GBP1P32455 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP1P32455 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GBP1P32455 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GBP1P32455 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP1P32455 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP1P32455 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP1P32455 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP1P32455 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GBP1P32455 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP1P32455 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GBP1P32455 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP1P32455 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GBP1P32455 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP1P32455 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP1P32455 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP1P32455 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP1P32455 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP1P32455 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP1P32455 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP1P32455 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GBP1P32455 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GBP1P32455 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GBP1P32455 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GBP1P32455 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GBP1P32455 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GBP1P32455 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP1P32455 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP1P32455 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP1P32455 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP1P32455 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP1P32455 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GBP1P32455 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP1P32455 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP1P32455 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP1P32455 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP1P32455 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP1P32455 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP1P32455 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GBP1P32455 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP1P32455 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP1P32455 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP1P32455 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP1P32455 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP1P32455 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GBP1P32455 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GBP1P32455 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GBP1P32455 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP1P32455 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP1P32455 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP1P32455 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GBP1P32455 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GBP1P32455 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GBP1P32455 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP1P32455 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP1P32455 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP1P32455 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP1P32455 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP1P32455 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP1P32455 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP1P32455 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GBP1P32455 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP1P32455 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP1P32455 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP1P32455 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP1P32455 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GBP1P32455 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GBP1P32455 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms