Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CASQ1P31415 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CASQ1P31415 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CASQ1P31415 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CASQ1P31415 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASQ1P31415 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASQ1P31415 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASQ1P31415 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASQ1P31415 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CASQ1P31415 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CASQ1P31415 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASQ1P31415 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASQ1P31415 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASQ1P31415 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASQ1P31415 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASQ1P31415 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASQ1P31415 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASQ1P31415 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CASQ1P31415 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASQ1P31415 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASQ1P31415 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASQ1P31415 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASQ1P31415 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASQ1P31415 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASQ1P31415 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASQ1P31415 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASQ1P31415 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASQ1P31415 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASQ1P31415 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CASQ1P31415 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASQ1P31415 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASQ1P31415 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASQ1P31415 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASQ1P31415 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASQ1P31415 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASQ1P31415 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASQ1P31415 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASQ1P31415 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASQ1P31415 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASQ1P31415 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASQ1P31415 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASQ1P31415 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASQ1P31415 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASQ1P31415 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASQ1P31415 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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