Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPOP30536 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPOP30536 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPOP30536 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPOP30536 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPOP30536 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPOP30536 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPOP30536 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPOP30536 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPOP30536 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPOP30536 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPOP30536 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPOP30536 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPOP30536 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPOP30536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPOP30536 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPOP30536 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPOP30536 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPOP30536 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPOP30536 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPOP30536 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPOP30536 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPOP30536 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPOP30536 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPOP30536 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPOP30536 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPOP30536 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPOP30536 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPOP30536 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPOP30536 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPOP30536 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPOP30536 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPOP30536 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPOP30536 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPOP30536 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPOP30536 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPOP30536 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPOP30536 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPOP30536 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPOP30536 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPOP30536 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPOP30536 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPOP30536 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPOP30536 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPOP30536 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPOP30536 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPOP30536 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPOP30536 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPOP30536 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPOP30536 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPOP30536 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPOP30536 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPOP30536 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPOP30536 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPOP30536 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPOP30536 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPOP30536 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPOP30536 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPOP30536 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPOP30536 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPOP30536 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPOP30536 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPOP30536 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPOP30536 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPOP30536 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPOP30536 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPOP30536 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPOP30536 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPOP30536 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPOP30536 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPOP30536 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPOP30536 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPOP30536 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPOP30536 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSPOP30536 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSPOP30536 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TSPOP30536 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSPOP30536 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSPOP30536 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSPOP30536 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSPOP30536 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSPOP30536 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSPOP30536 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSPOP30536 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSPOP30536 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSPOP30536 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSPOP30536 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSPOP30536 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPOP30536 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPOP30536 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPOP30536 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPOP30536 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPOP30536 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPOP30536 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPOP30536 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms