Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK6P29122 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCSK6P29122 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCSK6P29122 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCSK6P29122 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK6P29122 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK6P29122 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCSK6P29122 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCSK6P29122 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCSK6P29122 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK6P29122 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCSK6P29122 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCSK6P29122 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCSK6P29122 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCSK6P29122 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCSK6P29122 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCSK6P29122 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCSK6P29122 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCSK6P29122 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCSK6P29122 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCSK6P29122 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCSK6P29122 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCSK6P29122 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCSK6P29122 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCSK6P29122 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCSK6P29122 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK6P29122 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK6P29122 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCSK6P29122 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK6P29122 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms