Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFRSF8P28908 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNFRSF8P28908 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNFRSF8P28908 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNFRSF8P28908 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNFRSF8P28908 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNFRSF8P28908 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNFRSF8P28908 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNFRSF8P28908 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TNFRSF8P28908 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFRSF8P28908 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFRSF8P28908 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF8P28908 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF8P28908 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNFRSF8P28908 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNFRSF8P28908 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNFRSF8P28908 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNFRSF8P28908 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNFRSF8P28908 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNFRSF8P28908 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNFRSF8P28908 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNFRSF8P28908 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFRSF8P28908 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFRSF8P28908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFRSF8P28908 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFRSF8P28908 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF8P28908 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF8P28908 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF8P28908 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFRSF8P28908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF8P28908 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF8P28908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF8P28908 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF8P28908 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF8P28908 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF8P28908 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF8P28908 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF8P28908 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF8P28908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF8P28908 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF8P28908 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF8P28908 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF8P28908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF8P28908 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF8P28908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF8P28908 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF8P28908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF8P28908 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF8P28908 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF8P28908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF8P28908 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF8P28908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF8P28908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF8P28908 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms