Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABRB3P28472 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GABRB3P28472 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GABRB3P28472 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GABRB3P28472 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GABRB3P28472 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GABRB3P28472 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GABRB3P28472 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GABRB3P28472 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABRB3P28472 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABRB3P28472 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABRB3P28472 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABRB3P28472 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABRB3P28472 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABRB3P28472 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABRB3P28472 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABRB3P28472 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABRB3P28472 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABRB3P28472 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABRB3P28472 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABRB3P28472 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRB3P28472 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRB3P28472 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABRB3P28472 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABRB3P28472 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRB3P28472 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GABRB3P28472 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRB3P28472 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRB3P28472 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms